君科門診管理系統包含了系統管理、基礎信息、門診掛號、藥房管理、采購管理、報廢領用管理、藥品零售、門診醫生站管理(包含門診處方、門診病歷、輸液單，檢查檢驗處置單等)、門診收費、處方發藥、回訪管理、單據查詢、統計報表、患者欠費管理，就診卡功能（高級版還有會員卡管理、門診預交金等功能）。系統支持條碼槍、盤點機、各種打印機、語音報價器，會員讀卡器等設備。

君科門診系統適用于私營門診、中西醫結合門診、中醫門診部、西醫門診部、社區門診、大型門診、門診醫院、預防疾控中心，大型門診藥房等醫療機構。

★ 君科門診管理系統具有數據高度安全，各科室按照人員職能劃分權限、只能看到自己的功能,服務器放在門診內部防止處方流失、患者信息泄漏,財務信息泄漏等數據安全問題。
★ 君科門診管理系統支持門診就診卡管理、會員卡、門診預交金、支持會員讀卡器、支持收費語音報價器、入庫零售支持無線條碼槍和有線條碼槍，盤點機等功能;
★ 君科門診管理系統具有單獨的門診掛號功能呢，可以按照天、月、年統計掛號收費信息和患者就診信息，掛號模塊可以和君科分診系統、門診醫生站、門診收費、就診卡完美結合；
★ 君科門診管理系統具有高度的靈活性，患者不掛號，可以直接去醫生處就診，也可以脫離掛號脫離醫生站、直接去藥房購買藥品。也就是說收費發藥可以是一體化的，也可以分開獨立使用；
★ 藥品入庫還支持藥品生產日期、批次、效期的管理。對于過期藥品和滯后藥品或者將要過期的藥品，系統會及時給予您提醒，庫存支持超庫存報警和低庫存報警；
★ 君科病歷處方管理系統支持患者病歷處方存入電腦，隨時方便查閱、調用、分析、打印。能夠隨時跟蹤患者就診過程，醫生隨時掌握病人的用藥情況和治療情況；系統還可以根據處方自動生成輸液單；同時支持中藥處方開立和西藥處方開立。
★ 零售管理支持自動選批和手動選批兩種方式，有了零售模塊所以又適合門診和藥房一起的醫療機構，例如上面是門診、下面是藥房零售；
★ 收費處可以根據醫生開的處方直接進行劃價，不用二次錄入。大，直接語音播報本次收費多少，實際收費多少，找零多少、大減輕了收費發藥的壓力；
★ 患者欠費看病，欠了多少錢，看了多少次病，吃了什么藥、寫了哪些病歷，統統在您掌握之中，您不必為欠費記賬而煩惱；
★ 君科管理系統還有預估利潤統計，在庫藥品預估利潤管理能更加讓您隨時掌握藥品大概利潤，為您的進貨更有效的分析數據。哪種藥品賺的多，大概賺多少好錢，君科門診管理系統完全讓您了解到；
★ 強大的報表分析功能，日營業額統計、醫生工作量統計，門診利潤統計報表、營業利潤查詢、醫學統計分析、銷售統計、欠費報表服務費報表、有效期統計表、庫存成本、基價統計、單據查詢等,讓您不費任何力氣就可以統計到今天的營業日報,今天賣了多少藥，看了多少病人，成本是多少，銷售額是多少，利潤是多少，報表統統反應給您；

★ 系統集成了回訪管理系統和強大的復診提醒，大大的提高了患者的滿意度。